真耶穌教會創始於第一次世界大戰甫結束的1917年，是由張靈生、張巴拿巴、魏保羅三位道地的華人於北京所創辦，比江端儀所設的新約教會還早約半個世紀，稱得上是華人圈中追求“屬靈恩賜”的前輩教派。出生於山東的張靈生原名張彬，他在37歲時信主加入長老教會，並曾擔任執事三年，後因渴慕“靈恩”於1909年跑到上海的使徒信心會追求。張靈生自稱1910年於清晨靈修禱告時，被聖靈澆灌口出方言。1911年，他因閱讀了本安息日會的教義書籍而棄“主日”改守“安息日”。1913年，張靈生在自宅設立耶穌真教會。1917年，他搬到北京正式加入使徒信心會，並被該會按立為長老。(使徒信心會乃廿世紀初由美國興起的『五旬節運動』登陸中國所產生之靈恩教派。1907年，華北地區有群不滿教會冰冷現狀與僵化體制的基督徒，出走組織使徒信心會，後改名神教會，其正是今日中華神召會的前身，該組織直接催生了真耶穌教會；廿世紀聖靈有三波大浪潮席捲全球，第一波乃1901-20年的『五旬節運動』，著重方言等“語言性恩賜”；第二波乃1940-60年的『靈恩運動』，著重醫病、趕鬼等“能力性恩賜”；第三波乃1980年始的『新靈恩運動』，又名『靈恩更新運動』，著重預言等“啟示性恩賜”；目前應是最強的第四波『春雨運動----春(晚)雨的雨勢較秋(早)雨為大，秋雨後收割瓊麻、雜糧等“粗作物”，春雨後收割葡萄、橄欖、無花果等“高經濟作物”』，第四波焦點不在追逐『恩賜』，而在恢復『四重職份配搭事奉』，進行“拆毀、重建、合一”【珥二23~25、何六3】)。

同是出生於山東的張巴拿巴原名張殿舉，於1909年在張靈生的帶領下信主。張巴拿巴自稱在1910年時，於黃昏從田裡返家的途中，身體受感大震動並口說方言；原籍河北直隸的魏保羅本名叫魏恩波，在北京以經營綢緞為業，他本是倫敦會的信徒，但因受安息日會的教義影響，也改守“安息日”。有日，魏身染重病藥石罔治之時，被使徒信心會的一名長老為其按手禱告後奇蹟式痊癒，因此加入了使徒信心會，並被按立為長老。

魏保羅自稱1917年3月間，他被聖靈帶到北京永定門外的河邊，正當他跪在水裡禱告時，耳中聽見天上響起聲音說：『你要面朝下受洗』，於是他遵照指示受浸，感覺靈魂體都剎時潔淨了，他當下決定獻身全職事奉，於禁食39天後，聖靈向他啟示：『所建造的教會當取名真耶穌教會，以承接更正萬國教會之偏差的使命』(『真耶穌教會』一名實乃魏取自【約十五1我是真葡萄樹】之靈感；“在活水中低頭前仆”之獨特施浸方式列為該派最重要的一項教條)。魏保羅深覺過往所傳的均非真道，因此脫離使徒信心會，開始依其經歷四處傳道。1917年，魏於北京創設首間真耶穌教會聚會點，隔年張靈生、張巴拿巴加入，人稱『真耶穌三傑』。

1919年魏病逝，兩張共負建立真耶穌教會之使命，創辦了『萬國更正報』，展開文字佈道的工作，並向華北、兩湖、江浙、福建等地擴展教勢。到1945年抗戰勝利時，大陸各省已建立千處據點，信徒共約8萬人，以湖南、福建境內最多。(魏臨終前曾妄發基督再臨年日的預言)
1925年，本是台灣長老教會會友的黃呈聰，離台移居福建時接觸並加入了真耶穌教會。1926年，黃呈聰及另外五名遷閩的台籍信徒，隨同張巴拿巴返回台灣佈道，首站落腳在黃呈聰的故鄉彰化縣線西鄉，僅三天就有62名決志者施洗，並成立臺灣首間真耶穌教會(現名為伸港教會)，接著轉往嘉、南一帶。張巴拿巴一行人雖在台停留短短40天，卻建立了伸港、朴子、清水3所會堂。1937年真耶穌教會揮師花蓮；1946年進軍台東；1948年深入台灣西部各個山地部落，可見該派多麼看重原住民事工，其在台的信徒中原住民幾近半數。今天，走一趟花、東或橫貫、南北迴公路，隨處可見該派獨特的歐風教堂建築，醒目地矗立路旁。 1949年大陸淪陷，該派轉進台灣全力發展。1956年在台中北屯設立『台灣總會』，如今全台劃分成七個教區，拓植堂會約600間。目前，該派在歐、亞、非、美、澳五大洲共24個國家建有據點，由位於美國洛杉磯的『真耶穌教會國際聯合總會』統籌指揮，自由世界中的會友總數達80萬人，另當時未隨國民政府遷台留在鐵幕內的會友，該派自稱現已自行發展達百萬人之多。

真耶穌教會算是組織井然有序的教派，『神治民主制』是其特色，該派根據《哥林多前書三章21~23節》將『神、基督、信徒、工人(傳道、長執)』分高低尊卑關係。神與基督擺在信徒之上凸顯『神治』，工人列在信徒之下表明『民主』，信徒間彼此以『弟兄、姐妹』相稱呼，有『傳道』職而無『牧師』職。 為培育工人，該派設有四年制的神學機構，名為『真耶穌教會台灣神學院』。該派運用國、台語電臺廣播節目(名為『厝邊隔壁大家好』及『心靈視窗』)，以及『函授課程』進行教育與文宣，並辦有《聖靈月刊》、《青年團契》、《宗教教育》等三份雜誌，同時編印《信徒生活手冊》與數十本福音小冊，以及『個人加入真耶穌教會之見證』的單張。(每篇見證短文無不強力放送“ㄐ有阮係金ㄝ”，或陳述以前所待的教會有多差勁，對於真耶穌教會有相見恨晚之感慨，莫怪其它的教派會七竅生煙) 平心而論，該派信徒有強烈的時代使命感及傳福音之熱忱，是很值得學習的優點，只是該派自視為『晚雨聖靈所建的唯一真教會，專負末世收割之使命』，並錯引《以西結書四十三章2、4節；以賽亞書四十六章11節》往臉上貼金嚷道：『我們是《聖經》所預言的末世東方真教會』(比較【賽四十三5~7】)，擺出一副『只有我們有聖靈同在，你們通通無聖靈。只有我們能得救，你們通通被撇棄』的傲慢樣，並一再標榜自個是『充滿神蹟運行的真教會』，逮到別教派的人就纏磨著教人要『反覆禱告唸誦“哈利路亞讚美主耶穌”以“求聖靈”』，而模糊了『祭司香壇事奉』是以“代求”為天職，實在令人難以恭維並詬病。再加上『愛偷牽羊』的惡名在外，使得該派與其它教派間隔閡難交融，且該派眼高於頂，視它教派『所行及信仰與《聖經》不符』為由，從不把別教派當『肢體』，僅視為『朋友』(很矛盾Why？)。還好，這幾年由於漸多的教派經歷了“靈恩”，與真耶穌教會間的敵對隔閡似有緩和解凍的跡象。

真耶穌教會的『五大教義----浸禮、洗腳禮、聖餐禮、守安息日、受聖靈』。其中除了『聖餐禮』的主張與正統教派雷同外，其它四項教義皆不為它教派所認同，但由於該派在『基督觀』、『聖經觀』、『教會觀』、『末世論』等教義上並未違背《聖經》教導，所以採從寬認定的人會認為：『真耶穌教會應歸類於極端靈恩派而非異端』。不過個人以為，由於該派強調：『“五大教義”關係著“得救”』，實難脫『在十架恩典上添加個人功德』之嫌，已墮落跌碎在『因信稱義』的絆腳石頭上【羅九32、加五1~11】，除非該派揚棄『五大教義關係得救』的堅持，並不再主張『方言乃得救之憑證』，否則吾人從嚴認定該派實屬『十字架之仇敵』，乃『混亂真道』之異端教派。